镰刀菌的傅里叶变换红外光谱鉴别

摘要
参考文献
相关文章 (15)

全文: PDF (958 KB)
输出: BibTeX | EndNote (RIS)

摘要：傅里叶变换红外光谱结合多元统计方法应用于微生物的快速鉴定及分类是近几年发展起来的一门新型技术。文章用傅里叶变换红外光谱研究了镰刀菌属五种6株镰刀菌。在获得分辨率高、重现性好的镰刀菌全细胞组分的红外谱图基础上，分析了主要吸收峰的归属,确定了镰刀菌红外谱图3 000～2 800 cm^-1,1 800～1 600 cm^-1与指纹区3个分析灵敏区。根据分析灵敏区的差异性区分了不同种的镰刀菌，并在此基础上进行了系统聚类分析并对镰刀菌种间进化亲缘关系进行了比较。结果表明，可根据光谱峰位、峰值及吸收强度比鉴别镰刀菌，而系统聚类分析方法能更科学合理地鉴别镰刀菌及呈现种间相似性程度，但不适合反映镰刀菌遗传亲缘关系。傅里叶变换红外光谱技术所具有快速、精确，易操作等优点是必将成为微生物研究领域的一个重要工具。

关键词：镰刀菌;傅里叶变换红外光谱;鉴别

Abstract：Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy,in combination with multi-variate statistics,has been a novel tool to identify and classify microorganisms in recent years. In the present study,Fourier transform infrared spectroscopy was used to identify Fusarium belonging to F. oxysporum,F. moniliforme,F. graminearum,F. semitectum,and F. nivale. Distinct spectral differences among these strains were observed from their high-resolution and well-reproducibility infrared spectra in the frequency regions of 3 000-2 800 cm^-1,1 800-1 600 cm-1,and fingerprint region. According to the characteristic bands in these regions,different Fusarium species could be identified. And identification by hierarchical cluster analysis was more scientific and reasonable and it also presented a degree of comparability among these strains. But the result was not becoming on reflecting the characteristic of cladistics. FTIR shows high potential as a rapid,accurate and easy-to-use method for the identification of microorganisms. It will be an important tool in microbiological studies.

Key words：Fusarium;Fourier transform infrared spectroscopy;Identification

收稿日期: 2006-05-26 修订日期: 2006-08-28

中图分类号:

O657.3

通讯作者: 肖明 E-mail: xiaoming88@263.net

引用本文:

聂明¹,罗江兰¹,包衎¹,张伟琼¹,杨仕平¹,肖明^1,2*,李博². 镰刀菌的傅里叶变换红外光谱鉴别[J]. 光谱学与光谱分析, 2007, 27(08): 1519-1522.
NIE Ming¹,LUO Jiang-lan¹,BAO Kan¹,ZHANG Wei-qiong¹,YANG Shi-ping¹,XIAO Ming^1,2*,LI Bo². Identification of Fusarium by Fourier Transform Infrared Spectroscopy. SPECTROSCOPY AND SPECTRAL ANALYSIS, 2007, 27(08): 1519-1522.

链接本文:

https://www.gpxygpfx.com/CN/Y2007/V27/I08/1519

[1] Emma T S，Brenda D W，Anne E D,et al. Mycologia，2002，94(6)： 1032.
[2] Matthias P L，Georg F，Geneviève D,et al. Appl. Envir. Microbiol.，2003，69(6)： 3077.
[3] Jurgenson J E，Bowden R L，Zeller K A,et al. Genetics，2002，160(4)： 1451.
[4] Chulze S N，Ramirez M L，Torres A,et al. Appl. Envir. Microbiol.，2000，66(12)： 5312.
[5] ZHAO Chun-sen，MA Xing-xia，WU Ai-bo,et al(赵纯森，马星霞，武爱波,等). Journal of Huazhong Agricultural University(华中农业大学学报)，2005，24(3)： 254.
[6] GAO Tong-chun，YE Zhong-yin，WANG Mei,et al(高同春，叶钟音，王梅,等). Chinese Journal of Rice Science(中国水稻科学)，2001,15(4)： 320.
[7] CHEN Zhong-yi，LI Bo，CHEN Jia-kuan(陈中义，李博，陈家宽). Biodiversity Science(生物多样性)，2004，12(2)： 280.
[8] Hennequin C，Abachin E，Symoens F,et al. J. Clin. Microbiol.，1999，37(11)： 3586.
[9] Guarro J，Gene J. Mycoses，1992，35： 109.
[10] Emma E M J，Nora M C，Sarah C,et al. J. Clin. Microbiol.，2000，38(8)： 2902.
[11] Guadet J，Julien J，Lafay J F,et al. Mol. Biol. Evol.，1989，6(3)： 227.
[12] Hennequin C，Abachin E，Symoens F,et al. J. Clin. Microbiol.，1999，37(11)： 3586.
[13] Mareike W，Herbert S，Siegfried S. Appl. Envir. Microbiol.，2002，68(10)： 4717.
[14] Royston G，Eadaoin M T，Paul J,et al. FEMS Microbiol. Lett.，1996，140： 233.
[15] Goodacre R，Timmins E M，Burton R,et al. Microbiol.，1998，144： 1157.
[16] Ngothi N A，Kirschner C，Naumann D. J. Mol. Struct.，2003，662： 371.
[17] GUO Shui-liang,CAO Tong,CHENG Cun-gui(郭水良，曹同，程存归). Spectroscopy and Spectral Analysis(光谱学与光谱分析),2005，25(4)： 525.
[18] LIU Gang,LIU Jian-hong,SONG Ding-shan,et al(刘刚,刘剑虹，宋鼎珊,等). Spectroscopy and Spectral Analysis(光谱学与光谱分析),2005，25(7)： 1053.
[19] WANG Gong-chen，ZHENG Zhong，YE Qi-ming,et al(王拱辰，郑重，叶琪明,等). Guide to Identification of Common Fusarium Species(常见镰刀菌鉴定指南). Beijing： China Agricultural Science and Technology Press(北京: 中国农业科学与技术出版社)，1996. 21.
[20] CI Yun-xiang，ZANG Kai-sai，GAO Ti-yu(慈云祥，臧凯赛，高体玉). Chem. J. Chinese Universities(高等学校化学学报)，2002，23(6)： 1047.